国家一级博物馆，中国第一家国家级航海博物馆，旨在弘扬中华民族灿烂的航海文明和优良传统，建构国际航海交流平台，培养广大青少年对航海事业的热爱，营造上海国际航运中心的文化气氛。建筑面积46,434平方米，室内展览面积21,000平方米。馆内以“航海”为主题，“博物”为基础，分设航海历史、船舶、航海与港口、海事与海上安全、海员、军事航海六大展馆，渔船与捕鱼、航海体育与休闲两个专题展区，并建有天象馆、4D影院、儿童活动中心，涵盖文物收藏、学术研究、社会教育、陈列展示等功能。
上海科技馆坐落于上海浦东新区行政文化中心的世纪广场，占地面积6.8万平方米，建筑面积10.06万平方米，2001年12月18日开放一期展览，2005年5月开放二期展览。它是上海市政府为在新世纪提高城市综合竞争力和全体市民素质而投资兴建的重大公益性社会文化项目。
上海市奉贤区博物馆，始建于60年代。1994年5月20日奉贤博物馆重建。新馆占地面积约2万平方米，总建筑面积3.6万平方米，其中地上建筑面积1.9万平方米，地下建筑面积1.7万平方米，地上三层，地下一层。建筑主体由3个相互连接而又相对独立的空间构成，分为A、B、C三栋。相互独立的三个椭圆建筑通过屋顶的公共绿化及环形通道、二层连廊、一层的景观水系和公共空间层层连接，尤其是屋顶连绵起伏的坡度变化既呼应了城市规划中高度的控制又减轻对周边环境的压力，形成富有趣味的公众活动场地。
位于上海市青浦区赵巷镇崧泽村，总用地约1.3万平方米，总建筑面积3680平方米。是上海市“十二五”重点文化项目之一。崧泽遗址地处青浦区赵巷镇崧泽村，通过墓葬考古发现，这里是上海先民最初的家园。2014年5月18日，上海崧泽遗址博物馆对公众免费开放。
青浦博物馆创建于1958年10月1日，为“三馆一园”（文化馆、博物馆、图书馆、曲水园）组成机构之一，是全国较早成立的市县级博物馆之一。原址在老城区曲水园旁，分“历史之部”、“自然之部”，展出青浦自然、地理、物产的标本和革命、历史文物。1986年，博物馆拆除原展览厅以及城隍庙后院的危房，新建一座两层的仿古建筑作为陈列厅。1987年12月建成开放，面积1000多平方米。开设“青浦地方史陈列”和“青浦古文化陈列”两大主题陈列，尤其青浦古文化的陈列颇具特色，展出青浦崧泽遗址、福泉山遗址考古出土的史前文物，在全国文博界产生良好的影响。
董其昌书画艺术博物馆，坐落于松江区人民南路64号醉白池公园内，于2018年12月25日正式开馆运行，是以整理、研究、宣传董其昌书画艺术成就为主，兼顾松江画派和云间书派，面向世界开展中国书画理论、书画作品、人文交流和松江府文化底蕴的研究，利用网络数据平台，来开展松江历史文化特别是古代书画艺术的传承的专题博物馆，也是全国首家董其昌专题馆。
松江博物馆，是一所综合性地方博物馆。位于上海松江区中山东路 233 号。松江博物馆以征集、收藏、研究、陈列、宣传松江地区历史文化、文物为主。藏品包括陶、瓷、玉、金银、铜、木器等，计 5000 余件，并有古代典籍 2000 余套，其中有部分珍贵的善本、刻本。松江博物馆的基本陈列《流沙沉宝》，着力展示迄今为止松江地区出土的历史文物，其中包括西林塔地宫、方塔地宫出土的宋元明清珍贵文物。
南社纪念馆位于上海金山区张堰镇新华路139号姚光故居内，2004年5月建立，是国内首个全面陈列南社历史人物事迹的纪念馆，综合反映了20世纪初中国先进知识分子参与社会革命及各种文化活动的史实。
金山区博物馆作为金山地方史志类公益性博物馆组建于1984年，1988年12月正式向社会开放，2015年迁址至金山区金山大道1800号。金山区博物馆除本馆外，下辖金山区规划展示中心、上海南社纪念馆、金山卫抗战遗址纪念园、朱学范故居、白蕉艺术馆。开放至今，金山区博物馆及下辖单位获得了“国家级抗战纪念设施、遗址”、“上海市文明单位”、“上海市级爱国主义教育基地”...等多项国家级、市级称号。
嘉定博物馆创建于1959年，属地志性博物馆，馆址设在素有“吴中第一”美称的嘉定孔庙内。嘉定博物馆全年开放，并且对持有老年证、军人证、残疾证游客及学生团体实行免费。博物馆现有设在嘉定孔庙内的“科举陈列”、州桥历史风貌保护区内的嘉定竹刻博物馆及设在嘉定法华塔院内的“中国近代著名外交家顾维钧生平陈列”、“胡厥文生平陈列展览”等多个基本陈列，每年还配合相关工作及国际博物馆日、中国文化遗产日等推出各类临时展览。
