南京百家湖博物馆

南京百家湖博物馆位于钟灵毓秀的江宁百家湖畔，是2005年江苏省首家正式注册的非国有博物馆，她以优雅的自然环境，独特的建筑造型，浓厚的文化氛围、丰富珍稀的展品享誉业界，参观者无不从中感受到世界文明的博大精深和中华文化的丰厚底蕴，并受之熏陶。

南京永银钱币博物馆

永银钱币博物馆位于江苏省南京市秦淮区1865创意产业园C2栋，共分为两层，占地面积1600余平方米，内设4个主题展厅，1个临时展厅，文物专用库房及开放互动体验区等多个区域。

南京名城老字号博物馆

南京名城老字号博物馆，位于江苏省南京市老门东，据2020年9月国家文物局信息显示，现有藏品386件/套，包括老字号相关的老物件、工艺品、加工工具、文献、照片等。

南京海龙红木文化博物馆

南京金箔博物馆

中国金箔艺术馆，占地4000多平方米，是世界最大的真金箔陈列馆、中国唯一一个展现真金箔艺术的陈列馆，也是中国最大最全的箔类行业纪念馆。由南京金箔集团公司投资6000万兴建，展览大厅面积2000平方米，分8个展区：南京金箔的起源、金箔业发展史、金箔生产工艺、金箔用途、金箔文化、金箔精神、金箔业的未来趋向等，展出金箔艺术品包括金箔工艺品如“金卡”、“金箔画”、“金箔书”、去毒、养颜、护肤的金箔化妆品、金箔酒，以及金字招牌、各种金墙纸、金瓷砖、金马赛克、金瓦等等共3000多件，从一个侧面体现着世界金箔业的现状和发展方向。

南京钰缘泉博物馆

博物馆展览面积近1000平方米，长期对公众展出的展品大约有500多件，目前所展文物主要为两大类：一类为西汉到明清时期的陶瓷器文化，展出的瓷器蕴含着中华民族文化的精华，体现了东方艺术独有的魅力，其中作为镇馆之宝的元青花更是罕见珍贵、精美绝伦；一类为新石器时期到明清时期的玉器文化，通过馆内不同时期不同地域的玉器展示反映出中华民族崇尚玉文化，在广袤的疆土上均有发现玉文化并传承数千年的史实。

南京奥林匹克博物馆

南京奥林匹克博物馆是由国际奥委会委员、国际奥委会文化与遗产传承委员会主席吴经国先生创办，以第二届南京青奥会的举办为契机而建立，坐落在南京建邺区金沙江西街9号青奥村内。作为南京青奥会遗产的重要组成部分，南京奥林匹克博物馆以“回望历史、交融文化、见证成长、分享惊喜”为设计理念，以传播奥林匹克精神，宣传江苏（南京）杰出体育名人，开展体育文化教育活动为己任，致力打造江苏、南京的体育文化名片和全省青少年体育文化教育基地。博物馆展览主题为“百年薪火，青春南京”。全馆总占地面积7896平方米，主展区面积5034平方米，展示了1000余件珍贵展品，“现代奥林匹克之父”顾拜旦先生的亲笔手稿、历届奥运会火炬的展示墙、历届国际奥委会主席的蜡像等等，采用实物、图片、视频、互动体验等多种形式，全方位满足参观学习和文化教育的需求。南京奥林匹克博物馆的建立与南京青奥会的举办有着极大的关联，展出内容同时包括国际性与地方性的奥林匹克活动，引导参观者从不同角度了解奥林匹克精神。

金陵竹刻艺术博物馆

中国第一家以金陵竹刻为主题的民营性质的民间艺术博物馆，现展出竹刻藏品一百多件，以金陵竹刻艺术为主题兼有收藏、展示、创研、交流四大功能。

南京市宝缘斋博物馆

南京民间抗日战争博物馆

目前，博物馆拥有两座展厅三个基本展陈，分别为“1937·南京记忆”南京保卫战史实展、“不愿做奴隶的人们”抗战老兵资料展、“典籍里的红色中国”中国共产党革命文献展。博物馆共有藏品6100余件，图书4万余册，其中关于抗战历史的孤本善本800多本，开馆15年来博物馆共接待参观者约40万人次。根据国家文物局2018年针对全省非国有博物馆藏品备案登记工作的要求，2018年10月，我博物馆已将馆藏6100余件藏品上报备案。

南京市江宁区金陵佛教文化博物馆

隶属于南京牛首山文化旅游区管理委员会。金陵佛教文化博物馆设立了涵盖佛教文物等多个专题陈列区，主要分为三个展厅，分别为序厅、第一展厅、第二展厅，每个展厅都有其独特性及关联性。共有前言、佛教伽蓝、法融、牛头宗、塔基瘗藏及摩崖石刻、古迹名胜、历代文人墨客、诗歌与游记、后记九个部分。

南京直立人化石遗址博物馆